Ing. Jakub Říha, Ph.D.

Ing. Jakub Říha, Ph.D.
Institute of Mechatronics and Computer Engineering (MTI): Academic staff
(OABI): Senior researcher

E-mail:: jakub.riha@tul.cz
Office:: L 3.313
Tel.:: +420 48535 6335

Specialisation: CXI - Department of Applied Biology - bioinformatician

Publications

SHRESTHA, R. et al. Localized Corrosion Risk of 316L Stainless Steel in Deep Geological Repository Environment Journal of Materials Engineering and Performance NA: Springer New York, 2026, vol. NA, issue NA. P. NA. ISSN: 1059-9495.
HLAVÁČKOVÁ, V. et al. Survival Strategies of Indigenous Arsenic-Tolerating Bacteria in Polluted Mine Waters: implications for metal bioremediation Journal of Hazardous Materials NA: Elsevier, 2026, vol. NA, issue NA. P. NA. ISSN: 0304-3894.
BARTAK, D. S. et al. Bentonite sterilization methods in relation to geological disposal of radioactive waste: Comparative efficiency of dry heat and gamma radiation Journal of Applied Microbiology Wiley Online Library, 2025, vol. 136, issue 3. P. neuvedeny (17 stran). ISSN: 1364-5072.
MORALES-HILDAGO, M. et al. Gamma radiation in highly compacted FEBEX bentonite: Key microbial and mineralogical behavior for safety assessment of nuclear repositories Journal of Hazardous Materials Elsevier, 2025 P. neuvedeny (15 stran). ISSN: 0304-3894.
VELIANYK, V. et al. Microbial diversity at remediated former gold and copper mines and the metal tolerance of indigenous microbial strains Applied and Environmental Microbiology 1752 N ST NW, WASHINGTON, USA, DC, 20036-2904: American Society for Microbiology, 2025, vol. 91, issue 10. P. e02555 – 24. ISSN: 0099-2240.
všechny publikace
HLAVÁČKOVÁ, V. et al. Microbially influenced corrosion in epoxy-ceramic coated carbon-steel cooler Materials and Corrosion NA: Wiley-VCH (Germany), 2025, vol. 76, issue NA. P. 1154 – 1168. ISSN: 0947-5117.
MORI-BAZZANO, L. et al. Plastic degradation in Lake Geneva: Influence of depth, seasonal shifts, and bacterial community dynamics Science of The Total Environment Amsterdam: Elsevier, 2025, vol. 2025, issue 179615. P. neuvedeny (10 stran). ISSN: 0048-9697.
BURDOVÁ, H. et al. Rhizodegradation of diesel and PAH contaminated soils with Miscanthus x giganteus: Soil, plants, microbes and pollutants interactions after two seasons JOURNAL OF ENVIRONMENTAL MANAGEMENT London: Elsevier, 2025, vol. 381, issue 125208. P. neuvedeny (12 stran). ISSN: 0301-4797.
AMIRBEKOV, A. et al. Synergistic effect of Alnus glutinosa saplings and rhizosphere microorganisms on organochlorine pesticides remediation in contaminated soil chemosphere Elsevier, 2025, vol. 373, issue March. P. neuvedeny (10 stran). ISSN: 0045-6535.
ČERNÁ, K. et al. Towards standardized microbial hydrogen consumption testing in the subsurface: harmonized field sampling and enrichment approaches World Journal of Microbiology and Biotechnology Springer, 2025, vol. 41, issue 342. P. neuvedeny (17 stran). ISSN: 0959-3993.
ABDOLAHPUR MONIKH, F. et al. Analytical methods for quantifying PS and PVC Nanoplastic attachment to activated sludge Bacteria and their impact on community structure NANOIMPACT Amsterdam: Elsevier, 2024, vol. 35, issue July. P. neuvedeny (10 stran). ISSN: 2452-0748.
AMIRBEKOV, A. et al. Assessing HCH isomer uptake in Alnus glutinosa: implications for phytoremediation and microbial response Scientific Reports Berlin: Nature Research, 2024, vol. 14, issue 1. P. neuvedeny (14 stran). ISSN: 2045-2322.
BARTAK, D. S. et al. Dramatic loss of microbial viability in bentonite exposed to heat and gamma radiation: implications for deep geological repository World Journal of Microbiology and Biotechnology Dordrecht: Springer, 2024, vol. 40, issue 9. P. neuvedeny (19 stran). ISSN: 0959-3993.
NĚMEČEK, J. et al. Field study on the dynamics of microbial communities following biostimulation at organochlorine-contaminated sites Journal of Environmental Chemical Engineering London: Elsevier Ltd, 2024, vol. 12, issue 6. P. neuvedeny (11 stran). ISSN: 2213-2929.
POLÁK, M. et al. Reprezentace poruchových zón a diskontinuit v hydrogeologických modelech pro hodnocení bezpečnosti hlubinného úložiště radioaktivního odpadu [souhrnná výzkumná zpráva].
BARTAK, D. S. et al. Survivability and proliferation of microorganisms in bentonite with implication to radioactive waste geological disposal: strong effect of temperature and negligible effect of pressure. World Journal of Microbiology and Biotechnology DORDRECHT: Springer Science and Business Media B.V., 2024, vol. 40, issue 1. P. neuvedeny (14 stran). ISSN: 0959-3993.
NGUYEN, H. A. N. et al. The influence of controlled thermophilic composting of PLA bio-composites on bacterial community BIOREMEDIATION JOURNAL PHILADELPHIA: Taylor and Francis, 2024, vol. 2024, issue April. P. neuvedeny (8 stran). ISSN: 1088-9868.
YEAP, C. S. Y. et al. Transcriptomic analysis and cellular responses to nanoscale zero-valent iron in green microalga Raphidocelis subcapitata ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY San Diego: Elsevier, 2024, vol. 286, issue NOV 1. P. neuvedeny (14 stran). ISSN: 0147-6513.
HLAVÁČKOVÁ, V. et al. A protocol for the extraction of viable bacteria for identification of bacterial communities in bentonite Applied Clay Science ELSEVIER SCIENCE BV, 2023, vol. 232, issue FEB. P. neuvedeny (9 stran). ISSN: 0169-1317.
AMIRBEKOV, A. et al. Biodiversity in wetland+ system: a passive solution for HCH dump effluents Water Science and Technology London: IWA publishing, 2023, vol. 88, issue 12. P. 3095 – 3109. ISSN: 0273-1223.
NGUYEN, H. A. N. et al. Early stage biofilm formation on bio-based microplastics in a freshwater reservoir Science of The Total Environment AMSTERDAM: Elsevier, 2023, vol. 858, issue FEB 1. P. 159569. ISSN: 0048-9697.
ČERNÁ, K. et al. Metodika pro studium limitních faktorů pro přežívání a proliferaci mikroorganismů v bentonitové bariéře hlubinného úložiště, 2023
SOLER, J. et al. Predictive and Inverse Modeling of a Radionuclide Diffusion Experiment in Crystalline Rock at ONKALO (Finland) Nuclear Technology PHILADELPHIA: TAYLOR & FRANCIS INC, 2023, vol. 209, issue 11. P. 1765 – 1784. ISSN: 0029-5450.
HLAVÁČKOVÁ, V., ŘÍHA, J., LÍSKOVÁ, K. , and STOULIL, J. Stanovení síran-redukujících bakterií (SRB) na lokalitách určených pro ukládání VJP, 2023
CHUDOBA, J. et al. A Model of Isotope Transport in the Unsaturated Zone, Case Study Acta Polytechnica Praha: CZECH TECHNICAL UNIV PRAGUE, 2022, vol. 62, issue 4. P. 427 – 437. ISSN: 1210-2709.
CZINNEROVÁ, M. et al. Field application of glycerol to enhance reductive dechlorination of chlorinated ethenes and its impact on microbial community Chemosphere PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, 2022, vol. 309, issue 1. P. neuvedeny (9 stran). ISSN: 0045-6535.
SOLER, J. et al. Modelling of the LTDE-SD radionuclide diffusion experiment in crystalline rock at the Aspo Hard Rock Laboratory (Sweden) Geologica Acta BARCELONA: Univ Barcelona, 2022, vol. 20, issue 7. P. 1 – 32, I – XIV. ISSN: 1695-6133.
ČERNÁ, K. et al. Ověřená technologie předúpravy sterilních kompaktovaných bentonitových materiálů pro následné studium mikrobiologické aktivity [ověřená technologie]. 2022.
SOLER, J. et al. Predictive Modeling of a Simple Field Matrix Diffusion Experiment Addressing Radionuclide Transport in Fractured Rock. Is It So Straightforward? Nuclear Technology Taylor & Francis, 2022, vol. 208, issue 6. P. 1059 – 1073. ISSN: 0029-5450.
LANDA, J., ŘÍHA, J., CHUDOBA, J. , and VITVAROVÁ, J. Biorad – pokročilý SW nástroj k predikci efektivní dávky jednotlivce z radionuklidů uvolněných z úložiště Jaderná energie Husinec - Řež: Centrum výzkumu Řež s.r.o., 2021, vol. 2, issue 67. P. 32 – 39. ISSN: 2694-9024.
ŘÍHA, J. et al. BioRad [software]. Available from: https://omp-cxi-tul.github.io/BioRad/.
HOKR, M. et al. THMC modelování v rámci mezinárodního projektu DECOVALEX 2019 [souhrnná výzkumná zpráva].
HOKR, M. et al. Multidimensional model of flow and transport in fractured rock for support of Czech deep geological repository program, 2018
MARYŠKA, J. et al. Výzkumná podpora pro bezpečnostní hodnocení hlubinného úložiště v roce 2018 [souhrnná výzkumná zpráva].
ŘÍHA, J. , and KRÁLOVCOVÁ, J. Generation of transport paths in fractured porous media Acta Polytechnica 1. ed., 2017, vol. 57, issue 5. P. 348 – 354. ISSN: 1210-2709.
MARYŠKA, J. et al. Výzkumná podpora pro bezpečnostní hodnocení hlubinného úložiště v roce 2017 [souhrnná výzkumná zpráva].
MARYŠKA, J. et al. Výzkumná podpora pro bezpečnostní hodnocení hlubinného úložiště v roce 2016 [souhrnná výzkumná zpráva].
SEVERÝN, O. , and ŘÍHA, J. Konzultační práce a technická pomoc (III.2015-XII.2015) [souhrnná výzkumná zpráva].
KRÁLOVCOVÁ, J. et al. Výzkumná podpora pro bezpečnostní hodnocení hlubinného úložiště v roce 2015 [souhrnná výzkumná zpráva].
NEŠETŘIL, K., ŘÍHA, J., KURKA, J. , and NECHYBA, M. Hodnocení kvality či rizika budoucího využívání ploch z pohledu geotechnika: Testovací oblast Jezero Milada/Chabařovice . : , 2014.
NEŠETŘIL, K., ŘÍHA, J., KURKA, J. , and NECHYBA, M. Hodnocení kvality či rizika budoucího využívání ploch z pohledu geotechnika: Testovací oblast Most . : , 2014.
SEVERÝN, O., KOPETSCHKE, I., ŘÍHA, J. , and CAHELOVÁ, J. Konzultace a technická pomoc (IV.2014 – XII.2014) [souhrnná výzkumná zpráva].
MARYŠKA, J. et al. Výzkumná podpora pro bezpečnostní hodnocení hlubinného úložiště v roce 2014 [souhrnná výzkumná zpráva].

Topics of Student work

Správa studentských prací a projektů

Show all staff Co-workers at MTI

Ing. Jakub Říha, Ph.D.

Set filter to set related news and events to your interest